《12岁。第二季》讲述改编自日本漫画家米田菜穗创作的同名少女漫画。既不是大人，也不是小孩子，正处于微妙的年纪的六年级小学生绫濑花日。偶然间和同班的男同学目击了班导接吻的场面，也为了朋友的生理期来...

故事从龙（玉木宏）代理放产假的家庭科教师而就任新班导开始。川口春奈演3年辰班的副班导。志尊淳、古川雄大、玉城Tina、白鸟玉季演3年辰组的学生。